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科研汪的日常 38 再试一次

科研汪的日常 38 再试一次

作者: 007木子 | 来源:发表于2022-06-14 23:34 被阅读0次

近来,细胞实验进行的不太顺利,原计划1周之内完成的实验,拖了一个月还没找到合适的解决方案,心态也从沮丧变为麻木。

刚接到任务的时候跃跃欲试,毕竟硕士三年做的就是围绕细胞进行的相关实验,小小的细胞转染可不是手到擒来。然而现实啪啪打脸,单就转染质粒的获得就让科研汪开启了新世界的大门。

从大佬那里拿到的质粒量比较少,需要通过转化、涂板、培养等步骤来扩增,然后通过质粒抽提来获得转染所用的质粒。

正常的质粒转化涂板之后会得到长得满满的菌落,而科研汪得到的肉眼可见的小菌落只有5个,挑选其中最大的两个菌落进行质粒抽提,意外只得到5μg的质粒,(平行进行的组别得到20μg,且质粒小提试剂盒按说明书来看,能从1-5mL过夜培养的大肠杆菌菌液中纯化得到10-40μg高质量的质粒DNA,可直接用于DNA序列分析,各种酶促反应,PCR以及部分细胞系的转染等),好在测序的结果显示,虽然量少,但长出来的都是想要的目标质粒。

事情还没结束,这波质粒虽然序列是对的,但细胞转染的带光率很低(带荧光的都是转染上了目的质粒的细胞,平均每个视野里只有4-6颗带光的细胞)。于是乎第二波提质粒大戏上演,但同样的流程走下来,提出了50ng的东西(有可能是质粒浓度太低,也有可能测到的就不是目标质粒)。考虑大概率是菌体量太多,裂解不充分导致,因此第三次质粒抽提的时候将菌体分成两组,也稍稍增加了菌体裂解的时间,终于得到30+μg的质粒样品。

听上去简单的流程一波三折,接下来要换上新的试剂和细胞,再试一次!

参考链接:

1.质粒转化:

https://www.zhihu.com/question/509049594/answer/2291261676

2.质粒抽提:

https://baike.baidu.com/item/%E8%B4%A8%E7%B2%92%E6%8A%BD%E6%8F%90/6270362?fr=aladdin

3.质粒转染:

https://zhuanlan.zhihu.com/p/348712352

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