“只有通过诸多细微的、但是有利的变异慢慢且逐步的累积，一种复杂的本能才会经由自然选择而获得”，一些动物拥有特殊的本能，有的学者将自然选择学说应用于本能上，但达尔文并不赞同这种看法，他认为“选择作用对于个体和全族均适用，并且能够从中获得想要的结果”。
“家养动物的精神能力能够变异，并且这种变异能够遗传。在生活环境发生变化时，自然选择将所有略微有利的本能上的细微变异，积累到任意程度并不难。”自然中无飞跃，即使是变异也是缓慢的、持续的。
“博物学者们普遍持有一种看法，即一些物种通过相互杂交，变成了不育性的，从而阻止了它们的混杂。正如我将要表明的，并不能够通过各种程度不同的、持续的、有用的、不育性的保存而取得。不育性是亲种生殖系统中所存在的某些差别的偶然现象。”达尔文认为“能育性的降低不管在什么情况下都出自一个单独的原因，就是过于相近的近亲交配”。近亲交配除了会导致能育性的降低，还会使导致后代遗传病的发病率增加，随着科学的进步，人们逐渐认识到近亲结婚的危害，采取强制措施禁止近亲交配。
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