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Python数据处理从零开始----第四章(可视化)(11)多分

Python数据处理从零开始----第四章(可视化)(11)多分

作者: 柳叶刀与小鼠标 | 来源:发表于2018-11-25 15:19 被阅读493次

    目录

    Python数据处理从零开始----第四章(可视化)①Matplotlib包
    Python数据处理从零开始----第四章(可视化)②图形和轴
    Python数据处理从零开始----第四章(可视化)③散点图和误差棒
    Python数据处理从零开始----第四章(可视化)④误差图
    Python数据处理从零开始----第四章(可视化)⑤(韦恩图)
    Python数据处理从零开始----第四章(可视化)⑥(画布设置)
    Python数据处理从零开始----第四章(可视化)⑦(多图合并)
    Python数据处理从零开始----第四章(可视化)⑧火山图
    Python数据处理从零开始----第四章(可视化)⑨线性相关曲线
    Python数据处理从零开始----第四章(可视化)(10)ROC曲线

    Python数据处理从零开始----第四章(可视化)(11)多分类ROC曲线

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    R语言之可视化①⑤ROC曲线

    ===============================================
    用于评估分类器分类质量的ROC示例。

    ROC曲线通常在Y轴上具有真阳性率,在X轴上具有假阳性率。这意味着图的左上角是“理想”点 - 误报率为零,真正的正率为1。这不太现实,但它确实意味着曲线下面积(AUC)通常更好。

    多分类设置

    ROC曲线通常用于二分类以研究分类器的输出。为了将ROC曲线和ROC区域扩展到多类或多标签分类,有必要对输出进行二值化。⑴可以每个标签绘制一条ROC曲线。⑵也可以通过将标签指示符矩阵的每个元素视为二元预测(微平均)来绘制ROC曲线。⑶另一种用于多类别分类的评估方法是宏观平均,它对每个标签的分类给予相同的权重。

    • 第一步导入所需要的包
    # -*- coding: utf-8 -*-
    """
    Created on Sun Nov 25 14:24:20 2018
    
    @author: czh
    """
    %clear
    %reset -f
    # In[*]
    import pyupset as pyu
    from pickle import load
    import os
    os.chdir('D:\\train')
    import numpy as np
    import matplotlib.pyplot as plt
    from itertools import cycle
    
    from sklearn import svm, datasets
    from sklearn.metrics import roc_curve, auc
    from sklearn.model_selection import train_test_split
    from sklearn.preprocessing import label_binarize
    from sklearn.multiclass import OneVsRestClassifier
    from scipy import interp
    
    • 第二步导入所需要数据,本文所使用的是最常见的iris数据,预测输出变量是种类species,包含三种种类。
    # In[*]
    # Import some data to play with
    iris = datasets.load_iris()
    X = iris.data
    y = iris.target
    
    # Binarize the output
    y = label_binarize(y, classes=[0, 1, 2])
    n_classes = y.shape[1]
    
    • 第三步建立预测模型,这里使用的是支持向量机模型。
    # Add noisy features to make the problem harder
    random_state = np.random.RandomState(0)
    n_samples, n_features = X.shape
    X = np.c_[X, random_state.randn(n_samples, 200 * n_features)]
    
    # shuffle and split training and test sets
    X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(X, y, test_size=.5,
                                                        random_state=0)
    
    # Learn to predict each class against the other
    classifier = OneVsRestClassifier(svm.SVC(kernel='linear', probability=True,
                                     random_state=random_state))
    y_score = classifier.fit(X_train, y_train).decision_function(X_test)
    
    • 第四步将每一个预测点的分类都视作一个结果。

    比如100个样本三分类,就出现300个二分类结果。

    # Compute ROC curve and ROC area for each class
    fpr = dict()
    tpr = dict()
    roc_auc = dict()
    for i in range(n_classes):
        fpr[i], tpr[i], _ = roc_curve(y_test[:, i], y_score[:, i])
        roc_auc[i] = auc(fpr[i], tpr[i])
    
    # Compute micro-average ROC curve and ROC area
    fpr["micro"], tpr["micro"], _ = roc_curve(y_test.ravel(), y_score.ravel())
    roc_auc["micro"] = auc(fpr["micro"], tpr["micro"])
    
    • 第五步绘图
    # In[*]
    
    
    plt.figure()
    lw = 2
    plt.plot(fpr[2], tpr[2], color='darkorange',
             lw=lw, label='ROC curve (area = %0.2f)' % roc_auc[2])
    plt.plot([0, 1], [0, 1], color='navy', lw=lw, linestyle='--')
    plt.xlim([0.0, 1.0])
    plt.ylim([0.0, 1.05])
    plt.xlabel('False Positive Rate')
    plt.ylabel('True Positive Rate')
    plt.title('Receiver operating characteristic example')
    plt.legend(loc="lower right")
    plt.show()
    
    • 结论:这样我们就得到多分类情况下微观的平均ROC值
    # Compute macro-average ROC curve and ROC area
    
    # First aggregate all false positive rates
    all_fpr = np.unique(np.concatenate([fpr[i] for i in range(n_classes)]))
    
    # Then interpolate all ROC curves at this points
    mean_tpr = np.zeros_like(all_fpr)
    for i in range(n_classes):
        mean_tpr += interp(all_fpr, fpr[i], tpr[i])
    
    # Finally average it and compute AUC
    mean_tpr /= n_classes
    
    fpr["macro"] = all_fpr
    tpr["macro"] = mean_tpr
    roc_auc["macro"] = auc(fpr["macro"], tpr["macro"])
    
    # Plot all ROC curves
    plt.figure()
    plt.plot(fpr["micro"], tpr["micro"],
             label='micro-average ROC curve (area = {0:0.2f})'
                   ''.format(roc_auc["micro"]),
             color='deeppink', linestyle=':', linewidth=4)
    
    plt.plot(fpr["macro"], tpr["macro"],
             label='macro-average ROC curve (area = {0:0.2f})'
                   ''.format(roc_auc["macro"]),
             color='navy', linestyle=':', linewidth=4)
    
    colors = cycle(['aqua', 'darkorange', 'cornflowerblue'])
    for i, color in zip(range(n_classes), colors):
        plt.plot(fpr[i], tpr[i], color=color, lw=lw,
                 label='ROC curve of class {0} (area = {1:0.2f})'
                 ''.format(i, roc_auc[i]))
    
    plt.plot([0, 1], [0, 1], 'k--', lw=lw)
    plt.xlim([0.0, 1.0])
    plt.ylim([0.0, 1.05])
    plt.xlabel('False Positive Rate')
    plt.ylabel('True Positive Rate')
    plt.title('Some extension of Receiver operating characteristic to multi-class')
    plt.legend(loc="lower right")
    plt.show()
    

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