找到了一份种群基因组学数据分析的教程,原文用的数据是2015年发表在science上的一篇论文Genomic is...
排序 从vcf文件排序开始,可以使用picard,也可以使用vcftools 的vcf-sort vcf转换为pe...
1.vcftools或plink进行文件格式转换 vcftools --vcf myfile.vcf --plin...
vcftools是用来处理vcf和bcf文件的工具集,功能涵盖了过滤,数据格式转换,一些指标的统计计算,vcf文件...
vcftools是一种可以对VCF文件和BCF文件进行格式转换及过滤的工具,其中很多过滤及计算功能我们可以自己使用...
理论 种群核苷酸多样性,顾名思义指的就是核苷酸多样性,值越大说明核苷酸多样性越高。通常用于衡量群体内的核苷酸多样性...
==============转化vcf为plink格式============= vcftools --vcf...
1.vcftools是一种可以对VCF文件和BCF文件进行格式转换及过滤的工具。 2.输入参数 –vcf 支持...
vcftools --vcf my.vcf --plink --out plink plink--noweb--f...
本文标题:使用vcftools根据vcf文件计算种群核苷酸多样性
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