生信需求：

你有fastq文件，想按照5%，10%，20%，40%，60%，80%，截取fastq的数据量。

特点与功能：

1，随机截取，不是按照原始fastq中的顺序截取。
2，支持PE，和SE reads，
3，仅支持fastq格式。
4，目前仅支持固定比例。（5%，10%，20%，40%，60%，80%）。

用法：

usage: downsampling.py [-h] [-r1 READ1] [-r2 READ2] [-p PREFIX]

This is description

optional arguments:
  -h, --help            show this help message and exit
  -r1 READ1, --rd1 READ1
                        input read1 file
  -r2 READ2, --rd2 READ2
                        input read2 file
  -p PREFIX, --prefix PREFIX
                        prefix

举例 -p为输出文件的前缀。

python downsampling.py -r1  16E1L1_R1.fastq.gz -r2 16E1L1_R2.fastq.gz  -p 16E1L1

得到如下结果，输出结果的命名为：前缀+ 固定的后缀（xxpct_Rx.fq.gz）。

image.png