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火山图的本质是散点图，筛选数据后用Excel其实也能画，不过可能需要花点时间。而用Origin去完成数据的生成和颜色的映射会更方便一点。
今天主要是想借绘制火山图这一案例，为大家介绍Origin数据的计算生成、“速度模式”和参考线的添加。
数据准备
本例所用的数据是来自周老师ggplot2视频教程中的示例数据（点击 阅读原文 下载），如下。数据有47430行，首先要做的是删除一些不要的列（数据量较大，只需保留log2FC、FDR、significance这3列），然后另存为Excel的专用格式(xlsx)。
然后用Origin直接导入外部数据，方法如下。
对导入的数据稍作整理，然后新增1列空列，方法如下。
然后选中这一列，通过Analysis/Mathematics/Set Column Values，给新列计算相应的-log10FDR值。
在计算窗口中输入公式：log(Col("FDR"))*-1，如下图，点OK即可完成计算，非常方便。
计算的结果如下图，给这列新数据自定义列名（Long Name），我这里简单命名为y，数据的准备工作就完成啦。
图表绘制
通过Plot/Scatter/Color Mapped绘制散点图，如下图。
在Plot Setup窗口，给X轴、Y轴、映射颜色选择要绘制的数据，方法如下，点OK按钮完成绘制。
由于数据量较大（接近５万多个散点），Origin会提示自动进入Speed Mode（也就是仅显示一部分数据点，便于反复自定义调整而不必每次都进行大量的运算），初始的结果如下：
双击图表，在Plot Details窗口可调整散点的形状，大小，透明度等，如下。
还可以在Color List选项下自定义散点的颜色，如下图。
改完颜色后，右键图例，通过Legend\Reconstruct Legend更新一下图例，并改一下y轴的标题，得到的初始效果如下图。
添加参考线
双击坐标轴，在坐标轴调节窗口的Reference Lines选项卡下，先添加垂直的参考线，Reference Linesat Value输入框中输入-1 1（空格分隔），如下图，点Insert按钮，再点Apply按钮完成数据垂直方向参考线的添加。
点Details按钮可对参考线的颜色、线的类型、粗细等进行自定以设置。这里可同时选中-1、1两条线进行同时设置，如下图。
同样的方法，也可以添加水平的参考线，我这里输入1.301（LOG10(0.05)*-1）得到水平的参考线。同时，我也调整了下y轴和x轴的显示范围，结果如下图。调整满意后，点右侧的“速度模式”开关按钮（红色箭头所指），关掉Speed mode，让更多的点显示出来。
最终的效果如下：
更多的Origin视频教程可到Omicshare课堂观看，今天的内容就到这里啦~
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