FISH，即Fluorescence in situ hybridization，是RNA和DNA可视化的关键技术，而针对RNA和DNA的特异性探针设计又是关键中的关键。今天分析的是一篇Nature Method的研究，他们开发了一个用于针对全基因组，转录组亦或单个基因座位的FISH探针设计工具，可以进行在线的FISH探针设计—— PaintSHOP。
PaintSHOP
Reference
Hershberg, E. A. et al. PaintSHOP enables the interactive design of transcriptome- and genome-scale oligonucleotide FISH experiments. Nat Methods (2021).
FISH，即Fluorescence in situ hybridization，是RNA和DNA可视化的...
工具名称简介运行命令BaitDesigner (Picard)设计杂交捕获反应设计杂交探针用的" java -ja...
安装 方法1 更新清华源，用install自动安装。 方法2 下载ARBwget http://download....
Chorus2软件安装 conda 方法安装 conda安装python3.x环境 安装依赖包所有安装的包默认在p...
一般Taqman定量PCR实验过程为： 目的基因查找比对→探针与引物设计→探针与引物合成→配置反应体系→反应参数→...
js map 2021-07-08
bpftrace 是 Linux 高级追踪工具和语言。该工具基于 eBPF 和 BBC 实现了通过探针机制采集内核...
fish环境下安装好nvm后，但是启动不了。解决办法： 安装fisher包管理工具 在 config.fish 末...
监控分类 系统 业务 监控方法 探针（probing） 内省（introspection） 监控指标 指标设计方法...
概要 APM探针主要有侵入式探针和非侵入式探针。 其中侵入式探针以zipkin为代表，非侵入式探针以pinpoin...
本文标题：2021-07-08 FISH探针设计工具
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/jkotpltx.html
网友评论