以前处理fasta文件都是使用的python,因为有强大的Biopython。现在发现R也有很多包可以处理序列文件。然后借助这些包，做简单的少量序列比对工具。
http://qplot.cn/tools/tools-fasta/
使用场景：验证序列的方向，与目标序列比对。
1.输入标准fastA格式，然后可以单独对每条序列进行翻转，互补，截取。处理过的序列进行两两比对，或多序列比对。
image.png
2.处理结果，两两比对
3.多序列比对Muscle（还有点问题），ClustalW
用msaR展示
image.png
主要包：seqnr,Biostrings,msa,msaR
如果有其它功能需求，可以简书留言。
更多工具：http://qplot.cn/indexapp/
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本文标题：FastA多序列处理工具
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/kwaxhqtx.html
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