挂一个今天遇到的坑,竟然和bismark的版本有关!
看图:这个bismark_genome_preparation是默认bowtie1比对的
bismark_genome_preparation帮助文档
版本
结果才发现这个竟然是0.14版的
把这个版本升级一下,我们再看看帮助文档,这次升级的是2.0版本
版本信息
bismark_genome_preparation帮助信息
这里默认的变成了bowtie2了。不同版本的比对,真的是要好好比照一下了!
挂一个今天遇到的坑,竟然和bismark的版本有关!
看图:这个bismark_genome_preparation是默认bowtie1比对的
结果才发现这个竟然是0.14版的
把这个版本升级一下,我们再看看帮助文档,这次升级的是2.0版本
这里默认的变成了bowtie2了。不同版本的比对,真的是要好好比照一下了!
本文标题:这是bismark的版本坑
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