1.安装Miniconda

进入miniconda官网，选择合适自己的版本，以python3.7为例：

$ cd ~
$ wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh # 下载miniconda
$ sh Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh # 安装miniconda，一直按Enter键就好了,让输入Yes的输入进去
$ source ~/.bashrc # 将miniconda添加到环境变量中去
$ conda #若会返回conda 的帮助信息说明已经安装成功

2.配置channels

$ conda config --add channels r # 添加r channel
$ conda config --add channels defaults
$ conda config --add channels conda-forge
$ conda config --add channels bioconda
# 但是以上的channels都在国外，有时候下载速度很慢，所以需要添加国内的channels
$ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
$ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
$ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/

3.安装生物信息学软件

$ conda install 软件名
# 或者安装指定版本的软件
$ conda install 软件名=版本号
# 升级软件
$ conda update 软件名
# 如果不确定软件名称，可以先搜索
$ conda search 软件名
# 列出已安装的软件
$ conda list