Therapeutic Target Database(TTD)

1、TTD数据库简介

• 首先关于靶点的生物学定义是：

生物学靶点（英語：Biological target）是指位于生物体内，能够被其他物质（配体、药物等）识别或结合的结构。常见的药物靶点包括蛋白质、核酸和离子通道等。---维基百科

• 其次关于TTD数据库，官方简介为

TTD是一个提供目前已知或者处于探索阶段的、具有治疗价值的蛋白或核酸靶点的相关信息；包括靶点相关疾病、介导的生物学通路信息、以及作用靶点的药物信息。数据库记载的全部数据均是有参考文献来源的。

2、TTD数据库内容

2.1 靶点

• TTD数据库的核心是靶点数据，其余所有信息均是围绕靶点展开的；
• TTD将收录的靶点分为四类--如下，可信度又高到低
  • Successful：基于该靶点，已经有至少一种靶向药物批准；
  • clinical trial：该靶点的药物还处于临床研究阶段；
  • patent-recorded：靶点的靶向化合物具有专利保护；
  • literature-reported：有文献报道的靶点。
• 如下是目前近些年收录的靶点数目统计

2.2 药物

• 针对靶点的结合靶向结合药物，TTD分为了Approved、Clinical Trial、Patented以及Experimental四类

2.3 靶点的调控分子

• 这部分是TTD数据库近些年才收录的，认为靶点表达在生物过程中可能会受到多种生物分子的调控，包括microRNA、Transcription Factor、interaction protein(互作蛋白)
• 如下对数据库中靶点的调控分子记载的统计情况

2.4 其它

• 此外，数据库还收载了靶点的表达数据情况、相关的生物通路(pathway)、实验验证数据等
• 作为TTD的一个特点：它还专门收集了COVID-19靶点以及相关信息
• 如下图为TTD数据为对于一个靶点的全部信息内容

3、TTD数据库使用

• 数据库网址：http://bidd.nus.edu.sg/group/ttd/ttd.asp；镜像网址：http://db.idrblab.org/ttd/、http://db.idrblab.net/ttd/

• 进入数据库网站，可以直接搜索靶点，也可以通过药物、疾病搜索相关靶点等等；而且全部数据提供了下载界面，觉得还是很不错的。可以好好利用一下~