相比于原核生物，真核生物编码蛋白质的遗传信息并不是连续的，而是编码序列和非编码序列交替存在，因此要表达正确的蛋白质，需要将遗传信息中的非编码序列去除，这一步骤就是由剪接体(spliceosome)完成的。真核生物中的主要剪接体包括U1，U2，U4，U5，U65中snRNA和逾百种相关蛋白质。而以往针对剪接体中各成分的研究也主要集中在其对剪接过程的影响，这些组分是否具有非剪接功能并不清楚。今天分享的这项研究，则报道了U1 snRNA的非剪接功能，它通过与lncRNA互作可以调控这些lncRNA在染色质上的定位，进而影响基因转录。
U1 snRNA调控lncRNA的染色质定位
三言两语
1.开发REL-seq与mutREL-seq技术进行细胞内染色质定位关键序列的分析，发现定位于染色质的lncRNA中存在显著的U1 snRNA结合序列。进一步分析U1识别位点在lncRNA和mRNA上的分布发现，U1 snRNA识别位点在lncRNA 外显子上相比mRNA有更多的分布。
2.使用带U1 snRNA识别位点的探针进行RNA pulldown，并联合质谱，发现U1 snRNA介导的lncRNA 染色质定位也是依赖U1 snRNA相关结合蛋白。
3.对U1 snRNP中SNRNP70的互作蛋白鉴定发现，其除了与剪接相关蛋白互作外，还可以直接与延伸型RNA pol II及转录相关延伸因子互作，因此染色质定位的lncRNA是通过U1 snRNP与转录复合物偶联，发挥转录调控作用。
Reference
Yin, Y. et al. U1 snRNP regulates chromatin retention of noncoding RNAs. Nature 580, 147-150 (2020).
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