我一直印象BUSCO评估基因组使用augustus进行全基因组基因结构注释预测，然而似乎BUSCO从 version5 开始默认直接使用 metaeuk，不知道是好是坏。
简单检索了一下，发现了软件官网的一些讨论
大体是：
为什么我会看到这个问题。下述用甜橙基因组作为示例，跑一下两个模式。看起来两个模式似乎区别也不是很大，或许是因为我很机智的选了 arabidopsis，毕竟默认似乎是 fly....就不太适合植物了。
使用 augustus 预测
基因组组装完成后，可通过N50或者BUSCO，以及LAI评估组装质量。本文就LAI方法做一简单介绍。 基因组中的重...
基因组组装完成后，可通过查看contig的N50或者BUSCO，以及LAI评估组装质量。本文就LAI方法做一简单介...
基因组组装完成后，可通过查看contig的N50或者BUSCO，以及LAI评估组装质量。本文就LAI方法做一简单介...
基因组和转录组组装质量评估利器——BUSCO（Benchmarking Universal Single-Copy...
转载自 LAI: 评估基因组质量一个标准 基因组组装完成之后，就需要对最后的质量进行评估。我们希望得到的cont...
BUSCO是一款使用python语言编写的对转录组和基因组组装质量进行评估的软件。在相近的物种之间总有一些保守的序...
简介 BUSCO是一款对转录组和基因组组装质量进行评估的软件，它可以利用相近的物种的保守序列与组装的结果进行比对，...
BUSCO是Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs（通用单拷贝同...
基因组组装完成之后，就需要对最后的质量进行评估。我们希望得到的contig文件中，每个contig都能足够的长，能...
BUSCO[https://busco.ezlab.org] - 组装质量评估软件 BUSCO - Benchma...
本文标题：踩坑记录 | 小问题？BUSCO 评估基因组组装完成性的小问题
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/vaxhydtx.html
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