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生信分析 找了两年的预后marker+分子对接的思路,它来了

生信分析 找了两年的预后marker+分子对接的思路,它来了

作者: 概普生信 | 来源:发表于2021-02-25 09:30 被阅读0次

    19年我们在北京做分子对接培训的时候,就有很多客户问我们,临床生信就是找各种marker的,学习这个有啥用。

    小编从那时就开始找生物信息筛选marker和分子对接的思路。

    终于找到了,bia给大家。

    给大家分享一篇条理清晰干湿结合的好文章(杂志:International Journal of Biological Sciences  IF:4.858),文章对 1、如何寻找结直肠癌铁死亡因子 2、如何基于筛选到的铁死亡因子寻找潜在治疗疾病药物3、如何指导实验 做了详细描述,感兴趣仔细听!

    没食子酸能够抑制与结直肠癌预后相关的铁死亡相关基因

    1、筛选结直肠癌种差异的铁死亡因子(数据集:TCGA 阈值:p <0.05 and |log2 fold change (FC)| >1)

    2、差异铁死亡因子PPI网络构建及功能、通路分析(C图不太常见)

    3、差异铁死亡因子预后分析

    4、差异铁死亡因子相关性分析及表达差异验证(GEO数据集)

    5、预后相关铁死亡因子GSEA分析

    6、预后铁死亡因子与没食子酸分子对接分析

    7、细胞系实验验证没食子酸对结直肠癌的作用

    8、实验验证没食子酸对结直肠癌预后因子表达的影响

    9、动物实验验证没食子酸对结直肠癌的作用

    铁死亡跟癌症相关之外还与众多的非肿瘤疾病相关,对铁死亡、分子对接感兴趣的小伙伴记得联系哦!

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