什么是共线性(synteny)或同线性(colinearity)

你需要知道：

基因组( Genome)：指生物体所有遗传物质的总和。这些遗传物质包括DNA或RNA（病毒RNA）。基因组包括编码DNA和非编码DNA、线粒体DNA和叶绿体DNA。

数量性状位点(QTL)：就是一个性状由多个基因决定，每个基因对此性状都是微效的。

        植物基因组在染色体大小和数目上差异很大，在一些十字花科植物如拟南芥，只不过 100 Mb差异，而在百合属中竟高达 100000 Mb 。但是基因的数目和类型并没有这样明显的差别。不同植物基因组之间大小差异是由于基因组内存在重复 DNA 的缘故（多倍性这是一种原因）。

        在植物进化过程中，基因组大小变化是一种相对频繁的事件，但这些变化并不与基因多少及顺序变化相关联。基因数量及顺序的保守性称为同线性（colinearity），近来文献中越来越多地用共线性（synteny）来描述同线性（colinearity）和同源性（homeology）。共线性或同线性是一种令个惊奇的现象，拟南芥（双子叶植物）和水稻（单子叶植物）是由 2 亿年前的共同祖先分枝进化而来的，但两个物种仍可检测到尽管比较低的共线性。

        当不同禾本科植物基因组进行对齐和比较时，这种共线性就更加明显而有用。比如在玉米中鉴定到的重要农艺性状如颗粒重、抗虫性等性状，也与水稻的基因组序列相关。这使得鉴定这些性状的基因变得容易。 因为水稻基因组草图已经完成， 许多数量性状位点 （quantitative-traitloci，QTLs）也已经定位在水稻基因组图谱上。

援引自 新浪博客