PMID：33425212
发表杂志：Oxidative Medicine and Cellular Longevity
知识点
- Redox：氧化还原反应，在肿瘤的进展过程中作用显著。作者在GSEA中所示redox相关的通路，发现
GO_CELL_REDOX_HOMEOSTASIS和GO_RESPONSE_TO_REDOX_STATE，共两个redox相关的基因集。 - Redox-Related lncRNAs：Redox相关的lncRNA，设置标准：
Pearson Correlation Test, |Cor| > 0.5 and p.adj < 0.001. - DERRlncRNAs：Differentially Expressed Redox-Related lncRNAs (DERRlncRNAs)，差异表达的lncRNAs,
|logFC| > 1 and FDR < 0.05. - 内部验证：作者将TCGA-KIRC病人，按照1:1比例，随机分为training和testing组，构建预后模型。
摘要
作者提取差异表达的氧化还原反应相关的lncRNA，构建并内部验证预后模型，并分析不同风险评分的病理特征。
整体思路
亮点
- Redox相关lncRNA切入点比较新颖
结果
1.模型构建
作者通过差异分析+unicox+lasso+multiCox筛选了9个redox相关的lncRNA，在训练集中构建预后模型。
Fig.1
Table 2
模型基因互作关系
Fig.6
Fig.2
2.模型验证
选用TCGA的内部数据集进行验证
Fig.3
3.模型周边
3.1 Nomgram+C-index
对构建的模型，计算Nomgram和C-index
Fig.4
3.2 模型GSEA富集分析+临床相关性
Fig.5
Fig.7
参考链接：
Development and Validation of a Nine-Redox-Related Long Noncoding RNA Signature in Renal Clear Cell Carcinoma
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