16世纪的苏格兰女王玛丽·斯图亚特，被人们称为玛丽一世女王（不是英格兰女王那个“血腥玛丽”），她不仅在密码史是一位著名的人物，在整个欧洲史中也有着举足轻重的地位。
玛丽一世素以美貌和个人魅力著称，她不但能说六种语言，而且能读六种语言的书，不但天生有一个动听的歌喉，还能弹奏多种乐器。然而她的一生却极为跌宕起伏、传奇坎坷，后来更是卷入到了针对英格兰女王伊丽莎白一世的谋反事件中，因密信遭到破解而被处决。
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当时的英格兰和苏格兰这两个国家由于意识形态的差异（一个新教一个天主教），冲突不断。玛丽出生时，她的父亲詹姆斯五世刚刚在对英格兰的战争中被亨利八世击败，深受打击的詹姆斯五世身心完全崩溃，在玛丽诞生一个星期后便撒手人寰。
在这之后，9个月大的玛丽在斯特灵城堡的礼拜堂接受加冕，成为了苏格兰女王。
然而英格兰却并没有在这个时候继续进攻苏格兰。名义上是讲“出兵进犯一个新王只是女婴的国家，会被讥为没有骑士风度”，而实际上，英格兰国王改用怀柔政策，想安排玛丽与他的儿子爱德华成亲，借此将苏格兰纳入都铎王室的统治之下。
然而苏格兰人也看透了他们的意图，他们拒绝了英格兰的提议，反而让玛丽和法国皇太子弗朗西斯缔结了婚约。英格兰与法兰西可谓是百年的世仇，得知消息后终于恼羞成怒，大举入侵苏格兰，后来在法国的出兵援助下，苏格兰才躲过了这次危机，而6岁的玛丽也在几经辗转之后来到了法国。
之后玛丽度过了人生仅有的幸福快乐的10年，在16岁时，玛丽与弗朗西斯完婚，成为了法国王后。然而没想到，一向孱弱的弗朗西斯却病倒了，他在儿时感染的耳疾忽然恶化，发炎的部位扩散到脑部，引发脓疮。登基未满一年的弗朗西斯撒手尘寰，18岁的玛丽成为寡妇，只好又回到了苏格兰。
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然而经过十几年，玛丽发现苏格兰人民的信仰变了，变得更像自己的仇敌英格兰。接着她步入了人生第二次婚姻，嫁给了一个残暴的伯爵。这位伯爵甚至一度还想称王，还动过杀掉玛丽的念头。
6年之后这位伯爵被爆炸暗杀了，具体是谁策划的说不清，反正很多人怀疑是他的妻子玛丽干的。不过夫妻二人还是留下了一个儿子——詹姆斯六世。这个詹姆斯六世虽然昏聩奢侈，但借着自己的血统优势，最后居然成为了英格兰与苏格兰共同的王——詹姆斯一世，从而统一了“英伦三岛”。
第三次婚姻，玛丽嫁给了一个和他信仰相同的伯爵。但那时候苏格兰贵族因为信仰问题，也因为玛丽的生活作风问题，已经完全容不下这对儿夫妻了。结婚没几年，就把他们都抓起来了，伯爵被驱逐到丹麦，后来患上了神经病，10年后死在狱中。玛丽被监禁在苏格兰一座孤堡中，监禁期间他们生下的双胞胎也流产了。
1567年，苏格兰的新教贵族对他们的天主教女王不再抱任何希望，于是囚禁玛丽，强迫她让位给14个月大的儿子詹姆斯六世。1568年，玛丽逃出囚房，向南朝英格兰走去，寄望于她的表姑伊丽莎白一世能提供庇护。
可玛丽一世刚一到英格兰，就被姑姑囚禁在监狱中。
公开罪名是她把第二任丈夫杀害了，而真正理由是因为欧洲贵族复杂的亲属关系下，玛丽一世在英格兰女王王位上竟然也有继承权，而且顺位就排在她姑姑后面。在支持天主教的贵族眼里，玛丽一世才应该是正统继承人。所以她姑姑认为这个人太危险，还是关押起来更好，而且一关就是18年。
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1586年1月6日，被囚禁了18年之久的玛丽意外地收到一批信。
这些信来自玛丽的支持者，是吉尔伯特·基弗偷运进来的。基弗是天主教徒，他开始担任秘密信差，送信给玛丽，并带出她的回信。他用皮革把信裹起来，再把包裹藏在封塞啤酒桶的空心木塞里。酿酒商把酒送进查特里宅邸，玛丽的仆人打开木塞，取出藏在里面的信交给玛丽。将信息带出查特里宅邸也是用同样的方法。
此时，一项营救玛丽女王的计划正在伦敦的一个酒馆里酝酿着。该计划的中心人物是天主教贵族青年安东尼·贝平顿。他们一致认为，这项后来被称为“贝平顿阴谋”的计划需要玛丽的首肯才能进行下去。问题是，他们找不到与她通信的途径。
1586年7月6日，基弗来到贝平顿的门前。他送来一封玛丽的信，说她在巴黎的支持者提到贝平顿，她很期待贝平顿的来信。贝平顿随即写了一封长信，描述计划的轮廓。
一如既往，基弗把这封信放进啤酒桶的木塞里，蒙混过看守玛丽的人。贝平顿还采取了额外的措施，把信转换成密码——万一密函被玛丽的看守人拦截，他也无法解读内容。他所用的密码如下图所示。他用了23个符号来代替英文字母（不包括j、v、w），另有36个符号来代替单词或词组。此外，还有4个虚元（不代表任何字母，像空格一样不具任何意义的符号），以及一个用来表示下一个符号代表两个字母的重复符号。
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然而基弗表面上是玛丽的特务，实际上他却是一个双面间谍。每趟来回查特里宅邸的途中，他都会多拐一个弯将信送给英格兰的沃尔辛厄姆爵士。
得到贝平顿与玛丽的往来密函后，沃尔辛厄姆的第一目标就是解译它们的内容。全然了解密码学价值的他，曾在伦敦设立了一所密码学校，并聘任托马斯·菲利普当他的密码秘书。
菲利普是语言学家，通晓法语、意大利语、西班牙语、德语，而且更重要的是，他是欧洲最优秀的密码分析家之一。寄给或出自玛丽之手的信函，都被菲利普一一掌握。他是一位频率分析法大师，一旦破译出几个字母后，密码分析的工作就可以迅速速地开展下去了。
玛丽在函复贝平顿时，实质上等于签下了自己的死刑判决书。她于信中提到这个“计划”，尤其希望他们在刺杀伊丽莎白时，能先派人救出她。这封信在交给贝平顿之前，依例拐了个弯，来到菲利普手上。他很快就破译出这封信的内容。读毕，菲利普在信上标了一个绞刑架的符号。
一切证据都搜集全了，皇室成员和贵族旁听，法庭拿出证据，向公众解释了频率分析法破解密文的原理。法庭认定玛丽“图谋、设想各种能致使英格兰女王死亡、毁灭的事件”，因此判决有罪。
玛丽始终没有认罪，但伊丽莎白一世还是签署了死刑判决书。
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行刑那天，玛丽身着红色，表明她是一个天主教殉教者。她泰然走向刽子手说：“我诚心诚意宽恕你们，因为我正期待你们了结我所有的痛苦。”她躺在断头台上高呼：“主，我任您处置！”
据说当时刽子手第一刀砍下的时候，脖子并没有被砍断，玛丽当时对着刽子手呵斥：“把你该做的事做好！”这句话，吓得刽子手直哆嗦。砍了三刀之后，刽子手拎起玛丽的头颅示众，才发现那一头乌黑的长发原来是假发，假发套下已经满是花白的头发。
玛丽最初被埋葬在彼得镇大教堂，于1612年被她的儿子詹姆斯一世挖掘出来了，迁葬到威斯敏斯特教堂。在那里，她的墓穴和伊丽莎白一世的只有9米之遥。
这就是玛丽一世令人唏嘘的一生。
玛丽一世的死，意味着加密与解密双方的历史对抗中，解密方在当时已经完全占据了上风。移位法和替代法加密在频率分析法的强光下已经无所遁形，加密一方将如何挽回落后的局面呢？
这就是我们下一次要介绍的第三代加密法——维吉尼亚加密法。
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