薪酬管理作为企业人力资源管理的基础和核心对内，对于企业的稳定和发展具有重要的作用。所以企业要想获得好的发展，不仅要保证薪酬管理实现公平合理的原则，而且还要注重适时适当的创新。
一、没有形成合理的薪酬制度
企业都未建立合理的薪酬制度，影响企业人力资源部门制定的有关制度有机结合，无法充分发挥企业人力资源各个制度的功能，甚至有可能发生矛盾，从而影响企业人力资源管理效果。很多企业管理者仅凭谈判情况与以往经验定夺员工的薪资标准，缺少科学性，致使企业员工薪酬标准不统一，在进行薪酬决策时，主观因素作用大，没有科学依据，没有认识到要建立薪酬制度的必要性。
二、薪酬要素比例失衡
薪酬基本由工资、绩效工资、奖金和福利、津贴等部分组成。在一些企业中，对员工福利这一薪酬要素缺乏足够的重视。薪酬要素结构不合理往往影响企业的薪酬体系在运行过程的灵活性，无法形成对员工的短、中、长期激励效果。甚至在很多企业没有进行薪酬福利的设计，影响了薪酬激励作用的有效发挥。
三、薪酬分配政策不合理
很多企业的员工薪酬水平整体低于市场平均水平，再加上为了降低成本，往往对薪酬加以控制，使得多数中小民营企业的薪酬政策不合理，在进行薪酬分配时，企业不依据员工对企业贡献程度，而仅仅以员工所处级别及工作内容作为分配标准，致使中小民营企业薪酬管理缺乏竞争力，很难招收或留住优秀人才。
四、缺乏有效的薪酬管理激励机制
虽然绩效工资制是很多企业普遍采用的形式，而实际员工的工资没有同绩效结合，企业缺少科学合理的绩效评价标准，无法对员工工作贡献准确的衡量，导致薪酬与绩效不匹配，导致员工效率下降。且大大的消减薪酬激励功能。
五、薪酬分配缺乏公平性
由于种种原因，多数企业尚未建立全面、完善的薪酬管理制度。企业管理者主观随意性决定员工的薪酬，使企业内部员工工资标准不规范，造成企业同工不同酬或者同酬不同工的问题，使职工心里感到不公平，使员工没有认同感与归属感，影响了工作积极性。
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