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SDTM IG V3.3 中的变量-SPEC,-LOC,-LAT

SDTM IG V3.3 中的变量-SPEC,-LOC,-LAT

作者: 生物统计与SAS研究员 | 来源:发表于2021-02-21 12:41 被阅读0次

    一、名称解析

    SPEC:定义用于测量的样本类型。SPEC的名字来源于英文 Specimen(样本)。在PC,PP中该变量是Exp的,MI是Req的,其他均为Perm的。

    LOC:与测量结果相关的解剖位置。LOC很明显是来自Location,用来记录主题变量发生的位置,除了TULOC外都属于Perm变量。

    LAT:标本收集位置,进一步详细说明侧向性。LAT是来自Laterality,这个单词主要用作名词,作名词时译为“对一侧面的偏重”。也是记录发生位置的变量,属于Perm变量。

    DIR:标本收集位置,进一步详细说明方向性。DIR的名字来源于英文Directionality。也是记录发生位置的变量,属于Perm变量。

            这四类变量都和样本有关,SPEC是样本类型,LOC,LAT,DIR都是对位置的描述,其中LOC是记录修饰语,而LAT和DIR是变量修饰语。因此有理由相信,LAT和DIR所修饰的变量是LOC。

            LAT和DIR这两类变量非常的类似,就标签解释而言,LAT解释的是LOC位置的Laterality,而DIR解释的是Directionality。从字面理解LAT描述的是部位的具体侧面,DIR描述的是部位的方向性。从具体的受控术语中,不大能分清两者区别,目前通过行业内一些交流,有人认为LAT和DIR,前者突出左右关系,后者突出上下关系,比如左臂上部,会同时使用两种变量。但个人认为这可能是一些个案的情况。从两种变量的受控术语来看,这种说法不大可能覆盖所有可能。

            但我们可以看到,LOC基本上是围绕器官,身体构成部分展开的,LAT中基本上都是针对“侧面”的描述,DIR中则存在一些诸如 皮下,面部 等位置。所以最可能的解释是:LOC描述在器官,肢体层面进行描述,DIR在LOC的基础上对更细节的位置进行描述,LAT则描述器官或肢体的哪个侧面的信息。另外,LAT和DIR都是对LOC的修饰( DIR——>LOC<——LAT ),而不是一个线性的描述关系(类似 LOC<——DIR<——LAT)。

    二、应用范围

           SPEC涉及到的域全部是发现类,一共有8个,IS,LB,MB,MI,MS,PC,PP,SR。

            LOC涉及到的域有13个,EC,EX,PR,AE,MB,MI,MS,PE,TU,VS,FA,SR,MO。其中干预类3个(EC,EX,PR),事件类1个(AE),发现类9个(MB,MI,MS,PE,TU,VS,FA,SR,MO)。

            LAT涉及到的域有12个,EC,EX,PR,MB,MI,MS,PE,TU,VS,FA,SR,MO。其中干预类3个(EC,EX,PR),发现类9个(MB,MI,MS,PE,TU,VS,FA,SR,MO)。

           DIR涉及到的域有8个,EC,EX,PR,MB,MI,MS,TU,MO。其中干预类3个(EC,EX,PR),发现类5个(MB,MI,MS,TU,MO)。

    三、变量取值

    SPEC、LOC、LAT和DIR都是完全按照受控术语的赋值的:

    SPEC、LOC的受控术语种类繁多,需要具体查询

    LAT的受控术语有:BILATERAL,CONTRALATERAL,IPSILATERAL,LATERAL,LEFT,RIGHT,UNILATERAL。

    DIR的受控术语有:ANTERIOR,ANTEROLATERAL,ANTEROMEDIAL,ANTEROPOSTERIOR,ANTEROTEMPORAL,APICAL,BASAL,CAUDAL,CENTRAL,CRANIAL,DEEP,DISTAL,DISTAL VOLAR,DORSAL,DORSOLATERAL,FACIAL,FORE,FRONTAL,HIND,INFERIOR,INNER,INTERMEDIATE,LATERAL,LOWER,LOWER EXTENSOR SURFACE,LOWER FLEXOR SURFACE,LOWER MEDIAL,MEDIAL,MIDLINE,NASAL,OCCIPITAL,OUTER,PERIPHERAL,PERIVENTRICULAR,POSTERIOR,PROXIMAL,PROXIMAL VOLAR,ROSTRAL,SUBCORTICAL,SUPERFICIAL,SUPERIOR,SURFACE,TEMPORAL,TIP,UPPER,UPPER EXTENSOR SURFACE,UPPER FLEXOR SURFACE,VENTRAL,VENTROLATERAL,VOLAR,

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