代码实例假如以下这个脚本为Gene_length.py, 测试的fasta文件为test.fasta,输出文件为outfile
代码的运行命令(在linux中):python Gene_length.py test.fasta outfile
* 其中 ID = re.split(r'\.',line)[2] 这一步是因为原始fasta文件里ID名称是这样的>evm.model.Contig62652.1.我们需要的是Contig62652这一部分,这个ID是用.来分割,而我们需要的是第三部分,在列表中是属于【2】
网友评论