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python模块Proplot :高级分析绘图

python模块Proplot :高级分析绘图

作者: 单细胞空间交响乐 | 来源:发表于2021-07-15 00:25 被阅读0次

    Proplot对matplotlib进行了高度的封装,是一个高级绘图工具,其功能相当强大!而且融和了cartopybasemapxarraypandas。看到这里这应该就是我一直想要的绘图工具了!

    图片 图片

    如果你满足以下条件,那么Proplot是非常适合你的:

    •经常绘图,而且包含很多复杂的子图•经常需要对图进行标注和美化•几乎每天都要创建新的图形
    Proplot列出了matplotlib的很多不友好的方面,并通过封装来解决这些问题,提供更友好的交互方式。
    更少的代码,更多的图
    引入format方法去除了繁琐的图形设置问题,使用更少的代码,高度自定义图形。

    示例

    Proplot

    import proplot as plot
    import proplot as plot
    f, axs = plot.subplots(ncols=2)
    axs.format(linewidth=1, color='gray')
    axs.format(xticks=20, xtickminor=True, xlabel='x axis', ylabel='y axis')
    

    matplotlib

    import matplotlib.ticker as mticker
    from matplotlib import rcParams
    rcParams['axes.linewidth'] = 1
    rcParams['axes.color'] = 'gray'
    fig, axs = plt.subplots(ncols=2)
    for ax in axs:
       ax.xaxis.set_major_locator(mticker.MultipleLocator(10))
       ax.tick_params(width=1, color='gray', labelcolor='gray')
       ax.tick_params(axis='x', which='minor', bottom=True)
       ax.set_xlabel('x axis', color='gray')
       ax.set_ylabel('y axis', color='gray')
    plt.style.use('default')  # restore
    

    类构造函数

    通过类构造函数对类名较长,书写不友好的类进行了封装注册,并提供关键词参数进行自定义。
    自动化维度和图形间距
    添加新的设置选项控制图形的维度和间距,以更好的解决多子图所带来的图形间距问题。比自带的tightlayout更友好。
    去除冗余信息 matplotlib的子图share参数可以让子图共享轴,但是对于轴的标签、legend和colorbar等信息却无法进行处理,Proplot引入了新的Figurecolorbarlegend`方法处理这种情况,使多子图绘图更简洁。
    设置外部colorbarlegend matplotlib中为多个子图设置colorbarlegend时是非常麻烦的,尤其是需要自定义位置时。Proplot引入了新的框架处理此类问题。
    import proplot as plot
    import numpy as np
    plot.rc.cycle = '538'
    labels = ['a', 'bb', 'ccc', 'dddd', 'eeeee']
    f, axs = plot.subplots(ncols=2, span=False, share=1, axwidth=2)
    hs1, hs2 = [], []
    
    # On-the-fly legends
    state = np.random.RandomState(51423)
    for i, label in enumerate(labels):
        data = (state.rand(20) - 0.45).cumsum(axis=0)
        h1 = axs[0].plot(
            data, lw=4, label=label, legend='ul',
            legend_kw={'order': 'F', 'title': 'column major'}
        )
        hs1.extend(h1)
        h2 = axs[1].plot(
            data, lw=4, label=label, legend='r', cycle='Set3',
            legend_kw={'ncols': 1, 'frame': False, 'title': 'no frame'}
        )
        hs2.extend(h2)
    
    # Outer legends
    ax = axs[0]
    ax.legend(
        hs1, loc='b', ncols=3, title='row major', order='C',
        facecolor='gray2'
    )
    ax = axs[1]
    ax.legend(hs2, loc='b', ncols=3, center=True, title='centered rows')
    axs.format(xlabel='xlabel', ylabel='ylabel', suptitle='Legend formatting demo')
    
    图片

    subplot容器类

    matplotlib的subplots绘制超过1行1列的图形时返回2维数组,1行1列的图形返回1维数组,单个图形则返回Axes实例。Proplot通过封装进行了更改,尤其方便当所有的子图需要统一参数设置时,非常方便。当然也可以对每个子图进行自定义。
    import proplot as plot
    import numpy as np
    state = np.random.RandomState(51423)
    f, axs = plot.subplots(ncols=4, nrows=4, axwidth=1.2)
    axs.format(
        xlabel='xlabel', ylabel='ylabel', suptitle='Subplot grid demo',
        grid=False, xlim=(0, 50), ylim=(-4, 4)
    )
    
    # Various ways to select subplots in the subplot grid
    axs[:, 0].format(color='gray7', facecolor='gray3', linewidth=1)
    axs[0, :].format(color='red', facecolor='gray3', linewidth=1)
    axs[0].format(color='black', facecolor='gray5', linewidth=1.4)
    axs[1:, 1:].format(facecolor='gray1')
    for ax in axs[1:, 1:]:
        ax.plot((state.rand(50, 5) - 0.5).cumsum(axis=0), cycle='Grays', lw=2)
    
    图片
    新的及改进后的绘图方法
    matplotlib默认的设置画图是真的难看,pandasxarrayseaborn都进行改进,Proplot则将这些改进又进行了进一步封装优化。
    import proplot as plot
    import numpy as np
    
    # Pcolor plot with and without distinct levels
    f, axs = plot.subplots(ncols=2, axwidth=2)
    state = np.random.RandomState(51423)
    data = (state.normal(0, 1, size=(33, 33))).cumsum(axis=0).cumsum(axis=1)
    axs.format(suptitle='Pcolor plot with levels')
    for ax, n, mode, side in zip(axs, (200, 10), ('Ambiguous', 'Discernible'), 'lr'):
        ax.pcolor(data, cmap='spectral', N=n, symmetric=True, colorbar=side)
        ax.format(title=f'{mode} level boundaries', yformatter='null')
    
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    Xarraypandas整合

    传递xarraypandas数据结构给matplotlib进行绘图时,这些数据结构的元数据信息会丢失。如果要保留元数据,只能使用xarraypandas数据结构自身的绘图函数。而Proplot对这些函数进行了封装,可以更加友好的调用。

    Cartopybasemap整合

    这里就碰到两个工具各自的痛点了。Cartopy虽然和axes结合的比较好,但是代码冗长,而basemap则单独创建了新的对象,而不是原始的axes实例。
    而且这两个工具都要提供地图投影,选择地图投影又是让人非常头疼的事。因为地理图形数据通常存储在经纬度坐标中。ProplotCartopyBasemap整合到了ProjAxes format方法中。

    basemap的开发2020年之后将终止。目前Cartopy还存在一些缺点,比如标注坐标标签等问题,物理地图尺度、添加背景图等。一旦这些问题结局了,Proplot将移除basemap

      import proplot as plot
    import numpy as np
      offset = -40
      x = plot.arange(offset, 360 + offset-1, 60)
      y = plot.arange(-60, 60+1, 30)
      state = np.random.RandomState(51423)
      data = state.rand(len(y), len(x))
    
      # Same figure with and without "global coverage"
      titles = ('Geophysical data demo', 'Global coverage demo')
      for globe in (False, True,):
          f, axs = plot.subplots(
              ncols=2, nrows=2, axwidth=2.5,
              proj='kav7', basemap={(1, 3): False, (2, 4): True})
          for i, ax in enumerate(axs):
              cmap = ('sunset', 'sunrise')[i % 2]
              if i < 2:
                  m = ax.contourf(x, y, data, cmap=cmap, globe=globe, extend='both')
                  f.colorbar(
                      m, loc='b', span=i+1, label='values',
                      tickminor=False, extendsize='1.7em'
                  )
              else:
                  ax.pcolor(x, y, data, cmap=cmap, globe=globe, extend='both')
              if globe:
                  continue
              ix = offset + np.linspace(0, 360, 20)
              for cmd in (np.sin, np.cos):
                  iy = cmd(ix*np.pi/180)*60
                  ax.plot(ix, iy, color='k', lw=0, marker='o')
          axs.format(
              suptitle=titles[globe],
              collabels=['Cartopy example', 'Basemap example'],
              rowlabels=['Contourf', 'Pcolor'],
              latlabels='r', lonlabels='b', lonlines=90,
              abc=True, abcstyle='a)', abcloc='ul', abcborder=False
          )
    
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    colormap和属性循环

    matplotlib中的 ListedColormapLinearSegmentedColormap 着实难用。Proplot提供了更加友好的方法,而且提供了新的方法来创建colormap
    •**更智能的`colormap`归一化**
    

    Proplot提供了更方便的函数来处理colormap的归一化以及延伸的问题。

    import proplot as plot
    import numpy as np
    f, axs = plot.subplots(
        [[0, 0, 1, 1, 0, 0], [2, 3, 3, 4, 4, 5]],
        wratios=(1.5, 0.5, 1, 1, 0.5, 1.5), axwidth=1.7, ref=1, right='2em'
    )
    axs.format(suptitle='BinNorm color-range standardization')
    levels = plot.arange(0, 360, 45)
    state = np.random.RandomState(51423)
    data = (20*(state.rand(20, 20) - 0.4).cumsum(axis=0).cumsum(axis=1)) % 360
    
    # Cyclic colorbar with distinct end colors
    ax = axs[0]
    ax.pcolormesh(
        data, levels=levels, cmap='phase', extend='neither',
        colorbar='b', colorbar_kw={'locator': 90}
    )
    ax.format(title='cyclic colormap\nwith distinct end colors')
    
    # Colorbars with different extend values
    for ax, extend in zip(axs[1:], ('min', 'max', 'neither', 'both')):
        ax.pcolormesh(
            data[:, :10], levels=levels, cmap='oxy',
            extend=extend, colorbar='b', colorbar_kw={'locator': 90}
        )
        ax.format(title=f'extend={extend!r}')
    
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    全局参数设置
    Proplot提供了新的参数设置方法rc对象,用更加方便的缩略表示更新图形的全局参数。

    物理单位引擎

    matplotlib的默认单位是inches,这对于美国以外的用户来说是非常让人困惑的。Proplot引入了物理单位引擎来处理此类问题。

    .proplot文件夹

    matplotlib很难设计自己的colormap和颜色循环,而且也没有内置的方法保存以便以后使用。此外,使用自定义的.ttc.ttf.otf字体文件也很困难。Proplot则自动添加colormaps、颜色循环和字体文件到.proplot/cmaps.proplot/cycles.proplot/fonts文件夹中。
    通过register_cmaps, register_cycles, and register_fonts可以手动加载这些文件,而无需重启Ipython

    Python绘图精简实例附代码

    如何在论文中画出漂亮的插图

    首先看插图

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    还有源码,我加了详细的注释,应该不难理解

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    2.正态曲线图

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    代码:

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    3.云模型示意图

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    4. scatter-hist图

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    5.若干类型的图例

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    6.热图

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    效果图如下:

    图片 图片

    效果如下:

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    7.为点加标签

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    8.导入已有图片并进行修饰

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    9.热度方格图

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    10. 箱线图

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    双纵坐标

    legend不在一块

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    legend放一块儿

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    多个子图共用一个legend

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    就先介绍这么多了,python画图个人觉得比R要强大很多,感兴趣的可以去安装了!生活很好,等你超越~~

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