写在前面的话
本篇内容参考Cowell and Thler's第四版的细胞学，进行整理、持续补充，便于诊断的快查
【细菌】
例行性染色中，gram（+）或gram（-）的细菌，除分枝杆菌（Mycobacterium）都是蓝色至紫色。分枝杆菌（Mycobacterium）因其脂质的细胞壁，无法染上颜色。细胞内的细菌表示是活跃的细菌感染（原发性或二次性），细胞外细菌不具有特异性；单一形态的细菌群落会被认为是感染，多形态的可能是污染、正常菌群或者是混合性细菌感染
球菌
病原性球菌通常为gram+的葡萄球菌（Staphylococcus）、链球菌（Streptococcus）、消化链球菌（Peptostreptococcus）或消化球菌（Peptococcus）；前两者为好氧菌，后两者为厌氧菌
噬皮线菌（Dermatophilus congolensis）会以垂直和水平方向进行分裂，形成线装。其感染表皮形成痂皮样病变。抹片应抹痂皮下病灶。
A-C细胞内外球菌，D 呈链状排列的球菌
A-D 在皮肤病灶的压片，球菌是以垂直和水平方向进行分裂，形成长链状双球菌，其形态如同火车轨道，此为嗜皮线菌的典型特征
小型杆菌/短杆菌/球杆菌
大部分的小型杆菌为阴性菌，部分细菌为双极杆菌（bipolar rod）；具病原性且双极性的感觉都是阴性菌。常见的小型杆菌包括大肠杆菌（E. coli）和巴氏杆菌（Pasteurella）。在临床使用药物，可使用对gram（-）的药物应急处理，后续还是应该进行药敏试验。
A-B. 双极细菌
丝状细菌（Filamentous Rods）
造成皮肤或皮下问题的主要有土壤丝菌（Nocardia）或放线菌（Actinomyces spp.）。其他厌氧菌如细梭菌（Fusobacterium）和分枝杆菌（Mycobacterium spp.）也可能是丝状，但通常不是。显微镜下，它们外观长且细（丝状），呈浅蓝色，并且有间断的粉红色或紫色小间隔而形成“串珠样”。当看到这样的细菌时，需进行特殊培养。
典型丝状细菌
A. 猫肝脏抽吸物内的巨噬细胞，可见负染的分枝杆菌（瑞氏染色）；B. 细针抽吸硬实的肺部团块，当肺巨噬细胞内出现未染上颜色的杆菌，即细胞出现的透明条纹（箭号）时，可判定为分枝杆菌感染。C. 猫肝脏的分枝杆菌。D. 猫肝脏内的分枝杆菌（抗酸染色）
大型杆菌
具有病原性且有时会引起皮肤和皮下组织感染的大型杆菌包括梭菌（Clostridia spp），以及较部常见的杆菌（Bacillus spp.）。当怀疑大型杆菌为致病原时，好氧及厌氧培养必须进行。如看到有芽孢，则可能是梭菌的感染。
A. 散布的炎症细胞、红细胞和大型产芽孢杆菌，为梭菌的典型外观；B. 为A高倍镜图片；C. 可见多个被吞噬的产芽孢杆菌；D. 犬只团块内的梭菌
偶尔在许多家畜口腔可见无病原性大型杆菌如Simonsiella spp. ，其为纵向分裂而呈水平排列，使得单一大型细菌外观如同“脚印 footprint”。如在鼻腔冲洗中发现该菌，可能有口鼻瘘管。
Simonsiella 细菌
其实以前花了很多时间纠结gram（+）的鉴别诊断，因为它们都很容易引起肉芽肿性改变。但是它们形态（前文有提及）、染色特性、常见患病动物都有很大差异。下面附几个表格是以前整理和收集的，来源不明
分枝杆菌ddx ，来自以前做的ppt
这里的acid fast弱阳性，弱抗酸，我们通常会用fite染色，好像是ph值不一样
Norcardia
gram+鉴别诊断，来自压箱底的资料，来源已忘记
续上表
酵母菌、皮霉菌、菌丝型霉菌及藻类
Schenckii 氏孢子丝菌
Schenckii氏孢子丝菌（Sporothrix schenckii）感染（孢子丝菌病，Sporotrichosis）会引发突起的增生性皮肤病变，并且经常导致溃疡。猫的病灶会有大量病原，因而诊断较为容易，但犬较难发现病原。若出现剧烈的炎症反应但未发现原因时，应进行病原培养或送病理。
Sporothrix schenckii外观为圆形至卵圆形或梭型（雪茄状），长度为3-9微米（μm），宽度有1-3μm，颜色为苍白至中等蓝色，并伴随略偏离中心的粉红色或紫色细胞核。当Sporothrix schenckii只出现少量酵母菌样菌体，或是并非典型的梭形菌体时，应和荚膜组织浆菌（Histoplasma capsulatum）区分。
Sporothrix schenckii为土壤常在菌，会引起“玫瑰园丁病”（Rose Gardener's Disease），为人畜共患病。
A. 猫只皮肤病灶，可见化脓性肉芽肿性炎症反应与大量孢子丝菌；B. 巨噬细胞内有圆形、卵圆形或梭形的孢子丝菌；C. 破裂的巨噬细胞含有许多梭形的孢子丝菌；D. 高倍镜下，猫只检体内的孢子丝菌
荚膜组织浆菌 Histoplasma capsulatum
荚膜组织浆菌主要感染肺脏，但在全身性荚膜组织浆菌感染时，也会感染其他脏器。病灶中可能会存在大量病原，可出现在细胞外，但较常被巨噬细胞吞噬，少见被中性粒细胞吞噬。荚膜组织浆菌形状为圆形或卵圆形，但不会形成梭形。直径为2-4μm，呈苍白至蓝色，具有薄且清楚的空晕及1个偏心、新月形且嗜酸性至异染色性的细胞核。
A. 肺脏抽吸检体中的巨噬细胞有大量组织浆菌；B. 猫口腔一溃疡团块的刮屑检体；C. 化脓性肉芽肿性炎症反应，巨噬细胞内有一个正在出芽的和一个圆形未出芽的组织浆菌。
皮炎芽生菌（Blastomyces dermatitidis）
皮炎芽生菌感染（芽生菌病，Blastomycosis）可能会侵犯皮肤、眼睛和内脏。芽生菌病的皮肤病灶通常发生在动物的鼻部及四肢，其大多数为溃疡或增生性病变。
皮炎芽生菌为深嗜碱性、球形，直径为8-20μm，并且有厚壁。大多数的病原为单颗出现，偶尔可见宽底出芽生殖，或是被巨噬细胞吞噬。皮炎芽生菌较大，须和新隐球菌（Cryptococcus neoformans）区分，即芽生菌具有相异的染色特性、缺乏无染色性的荚膜，以及宽底出芽生殖。与粗球霉菌（Coccidioides immitis）进行比较时，芽生菌形态较小且无内芽孢（endospore）。
A. 皮炎芽生菌在Romanowsky染色抹片下，是蓝色、球形、具有后壁的酵母样病原（箭号），其直径约为8-20μm。偶尔可见宽底的出芽。B. 淋巴结抽吸物中可见出芽的芽生菌。C. 来自犬只肺脏抽吸物的芽生菌。D. 来自犬只肺脏抽吸物的芽生菌。
新隐球菌
新隐球菌感染（隐球菌，cryptococcusis）可侵犯皮下组织，进而导致鼻部的结痂性结节病灶，但是其通常是侵犯上呼吸道和中枢神经系统。隐球菌病大多数引发肉芽肿性反应，颗粒球数目极少。在免疫抑制的动物中，炎症反应极其轻微。隐球菌外观多形性高，可能是球形至梭形，但因其具有厚且无法染上色的粘液样荚膜，通常容易辨认，但偶尔可见小型、无荚膜或粗糙型的隐球菌；若不含荚膜，其直径约为4-15μm，而包含荚膜的直径为8-40μm。在例行性血液染色中，病原呈嗜酸性至异染，也可能轻微颗粒样。荚膜一般为透明且均值，但是部分病例可能会呈淡红色。不同于芽生菌，隐球菌为细底出芽生殖，即“蜂腰出芽生殖”（wasp-waist budding）。部分新隐球菌具有人畜共患风险。
A. 可见大量隐球菌，具有透明荚膜的中形酵母菌（注意图中未见炎症反应）；B. 隐球菌的窄底出芽生殖；C. 2个具有窄底出芽生殖的隐球菌；D. 脑脊液中的隐球菌；E. D图其他视野；F. 淋巴结抽吸物有大量隐球菌、1个中性粒细胞以及散布的淋巴球和红血球。
粗球霉菌（Coccidiodes immitis）
粗球霉菌感染通常侵犯肺脏与骨骼，部分也可由骨骼衍生至皮肤，形成瘘管。粗球霉菌很少出现在病灶内；可见的小球体（Spherules）为大且呈蓝色或透明，直径10-200μm，具有双层轮廓及细致颗粒性原生质（Protoplasm）的球体，但因体型大而可能出现皱褶。部分较大的菌体可能会有多个直径为2-5μm的圆形内芽孢，而且有些小球体破裂后内芽孢则会掉落在细胞外。由于粗球霉菌的大小差异极大且含有内芽孢，故可与宽底出芽生殖的皮炎芽生菌区分。此为人畜共患病。
A. 低倍镜野下可见化脓性肉芽肿性炎症反应及2个大型的粗球霉菌，此病原需与芽生菌进行鉴别诊断，本病原较大且会产生孢子；B. 同A图病原的高倍视野。C. 此图可见2个粗球霉菌（箭号）有显著的大小差异。D. 含有内芽孢的大型粗球霉菌
E. 大型粗球霉菌破裂而释出内芽孢，此图亦可见小型的粗球霉菌（箭号）
马拉色菌（Malassezia canis）
犬马拉色菌（Malassezia canis）又称为厚皮症马拉色菌（Malassezia pachydermatis），是小型、无菌丝且行宽底出芽生殖的格兰仕阳性酵母菌，呈花生状，但也可能是球形或椭圆形。此病为机会致病菌，常引起犬只常见的外耳炎及马拉色菌相关性皮肤炎，足皮肤病常见于小白狗。
A. 耳拭子检体可见大量犬马拉色菌，粘附于角质化上皮细胞；B. 马拉色菌为球形，且会行宽底出芽，呈8字形（箭号）或雪人形（箭头）
皮霉菌
小芽孢菌（Microsporum）与发癣菌（Trichophyton spp.）经常引起皮肤霉菌病（Dermatophytosis）或钱癣（ringworm）。病灶通常为局部性且有痂皮、鳞屑，而且可能出现头部、脚和尾部的脱毛。皮肤霉菌病属于人畜共患病。
可使用10%氢氧化钾溶液染毛发、新甲基蓝（new methylene blue）染色的湿抹片或是例行性血液学染色的风干抹片皆可鉴定。霉菌菌丝和分节芽孢（arthrospore）会粘附在上皮细胞表面、游离在抹片背景或出现在毛干内（发癣菌属）和毛干表面（小芽孢菌属）。
A. 毛干表面可见霉菌孢子，菌丝体（mycelia）和孢子会染色呈蓝色至深蓝色，并且有薄壁透明空晕。B. 毛干上可见霉菌菌丝体和孢子；C. 高倍镜下的霉菌菌丝体。D. 此图可见霉菌菌丝体和孢子附着于上皮细胞表面及散布于抹片背景；E. 未染色抹片下的霉菌（钱癣）菌丝体和孢子。F. 与E相同的病例高倍视野
西氏鼻芽孢菌（Rhinosporidium seeberi）
西氏鼻芽孢菌是引发鼻芽孢虫病（Rhinosporidiosis）的真核病原，可感染许多动物，多分布于热带。典型特征为鼻腔出现具颗粒性息肉，形态似肿瘤，可由鼻分泌物或组织压片鉴别。圆形至卵圆形，直径为7μm的孢子，在染色下为亮粉红色，内含嗜酸性球状颗粒，并且为双层的薄细胞壁所围绕。大型孢子囊（Sporangia）内有大量孢子可作为诊断依据。
A. 鼻芽孢虫病，鼻腔表皮细胞边缘可见3种不同的病原形态（黑色箭头）。图片底部的大型圆形结构为较小的孢子囊（sporangium），而且周围有许多孢子或内芽孢（蓝色箭头，当孢子或内芽孢没有展开时，其染色会较深，但展开时则是粉红色至粉紫色。此图可见小型未成熟的孢子或内芽孢（黑色箭头）；B. 大量发育中的孢子或内芽孢围绕在破裂的大型孢子囊周围；C. 细胞碎片中有大量散布的孢子或内芽孢；D. 在高倍镜下，成熟孢子或内芽孢（蓝色箭头）会有厚细胞壁及嗜酸性球状体（蓝色箭头），亦可见未成熟的孢子或内芽孢、中间型（intermediate form）（黑色箭头）；E. 西氏鼻芽孢菌的未成熟孢子或内芽孢；F. E图的高倍视野，可见未成熟孢子或内芽孢的细部构造，为球形的淡嗜碱性结构，内含被认为是细胞核物质的紫色区域（箭号），以及一个以上的深蓝色球形构造。
肺囊虫属（Pneumocystis）
肺囊虫为肺脏的地方流行性机会性霉菌病原，可见囊体（直径5-10μm，可能含有高达8个内囊胞体，intracystic bodies）或营养体（直径1-2μm，trophic form）。数种肺囊虫都会感染动物和人类，例行性染色后易发现完整的囊体及明显的内囊胞体，但小的营养体较难观察，难于和细胞碎片区分。虽然形态似原虫，但是其实是霉菌的一种。
卡氏肺囊虫（Pneumocystis carinii）的囊体，直径约5-10μm，通常有4-8个直径约为1-2μm的内囊胞体
会形成菌丝的霉菌
在这里包括了很多霉菌，如最常见的曲霉菌，会引起肉芽肿性炎症。有些菌丝无法用染上色，因而形成负染色影像。如藻菌病（phycomycosis）是无法染上颜色，呈现嗜酸性肉芽肿性炎症反应。
霉菌菌丝
A. 原藻病可见大量圆形至卵圆形的病原（箭头），负染区域为病原的空壳；B. A的高倍视野，可见许多圆形至卵圆形的病原且有大多含有内芽孢（箭头），大多数病原周围均有薄而透明的细胞壁（箭号）
真菌也有一张以前不知道哪里搞来的表格，分享一下
之前旁听医学院的课，其实真菌也蛮有戏的，生活史也很晕，有一些是机会致病菌有一些是本人就很毒，但是资料可能不太好找，如看到合适的再丢上来
真菌鉴别表格
原虫
利什曼原虫（Leishmaniasis）
利什曼原虫可引起皮肤和皮下组织病变，引发大小不一、增厚且溃疡的皮肤炎病变。利什曼原虫小且椭圆形，大约2-4μm，其有卵圆形的淡紫色细胞核，以及特征性的小型深紫色棒状动基体（kinetoplast）。动基体与细胞核的相对位置会有差异，常位于细胞核与大量细胞质之间。动基体可用于分辨弓虫和小型酵母菌。
利什曼原虫
弓虫（Toxoplasma gondii）
弓虫感染的动物常不表现出严重的临床疾病，但可能导致眼部受损；严重的病例也可导致消化道、呼吸或神经系统损伤。可在组织或体液检查中发现。速殖子（tachyzoite）呈梭状至新月状，长约2-4μm，具淡蓝色的细胞质及紫红色的细胞核。难于和犬新包虫（Neosporum caninum）的速殖子区分，可用PCR进一步区分。
犬新包虫（Neosporum caninum）
犬新包虫是一种球样寄生虫，与弓虫类似。犬大多为先天性感染且经常会致死，侵犯的组织不均特异性。
弓虫速殖子（tachyzoites）
猫胞簇虫（Cytauxzoonosis）
胞簇虫（Cytauxzoon felis）常导致猫的死亡。短尾猫是其自然宿主，可由壁虱传染给其他猫。发育中的裂殖子（merozoite）可能会出现在巨噬细胞内。在抹片中，红细胞可能会出现戒指状的胞簇虫。
胞簇虫
以上整理是作为平时工作快查的参考资料，无商业用途
之后会陆续补充，作为看书的时候的整理，大多是从砖头书里或是谷歌里捞出来的
如有错误/错别字请多包涵！
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