行业组织对内的治理主要通过以下方式来实现：
第一，行业组织帮助企业开拓市场。一般来讲，单个企业，交易分散，组织化程度低，达成交易的信息成本、外部竞争成本、谈判成本、签约成本都很高，与此同时，市场风险和经营风险也很大。行业组织通过信息咨询、资信评估、价格协调等，能克服企业信息的不充分和不对称，有效地帮助企业节约交易成本；行业组织通过认真的调查研究，建立信息共享平台，为企业提供信息服务，降低企业的信息成本；行业组织通过提供培训、辅导服务，使企业员工技能知识不断更新，以此提升企业产品技术含量，增强企业的技术创新能力，提高企业的经济活动能力，促进企业业务发展。
第二，行业组织促进企业经营管理规范化。目前，中国企业普遍存在着企业管理层管理水平不高，管理观念陈旧，人员任用任人唯亲，管理方式过度集中，不够民主等现象。行业组织，作为自律组织，通过建立行业组织内部利益协调机制，可以在制定行业标准、协调市场、协调价格、破除贸易壁垒、规范用人制度、规范市场秩序、组织反倾销和反补贴等行动中发挥重要作用，避免或解决各行业组织之间、行业组织内部成员之间在竞争过程中的利益冲突，协调其成员的经营业务活动，规范各组织成员的行为，维护、提升行业的独立性，制止行业组织成员恶性压价，同行诋毁等不正当竞争行为，以实现行业竞争的良好秩序，以此达到企业经营管理行为的规范。
由于行业组织大多是由各行业的企业根据利益需求而组建的，没有官方的深入参与，因而在治理方式上，在行业组织内部，每个企业组织都有很大的发言权，正是这种民主的治理方式保证了行业组织的蓬勃生机与活力。
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