美文网首页生物信息学
PICRUSt功能预测软件安装

PICRUSt功能预测软件安装

作者: quan575 | 来源:发表于2017-03-02 16:36 被阅读375次

Ubuntu安装picrust

参考:http://picrust.github.io/picrust/install.html#install

##准备环境
pip install numpy==1.5.1
##后面用到h5py
sudo apt-get install libhdf5-dev
sudo apt-get install python-h5py

##如果运行脚本遇到numpy相关的问题,更新几个相关的库
pip install --upgrade numpy scipy pandas


##下载解压
wget https://github.com/picrust/picrust/releases/download/1.1.0/picrust-1.1.0.tar.gz
tar -xzf picrust-1.1.0.tar.gz
cd picrust-1.1.0

#下载好的 **16S拷贝数** 及ko文件放在picrust/data文件夹
##安装
sudo python setup.py install

相关文章

网友评论

    本文标题:PICRUSt功能预测软件安装

    本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/tjlkgttx.html