昨天分析的DART-seq是基于m6A 修饰位点识别功能域与RNA编辑酶融合,借助RNA编辑酶的A-I编辑活性,可以推测潜在的m6A修饰位点。并且最后也提到能否通过将其他RBP与RNA编辑酶融合,实现RBP的RNA靶标组分析。一查,还真有人做了,今年5月7日发表在Nature Method的STAMP (Surveying Targets by APOBEC-Mediated Profiling)方法就是基于这种策略进行RBP的靶标鉴定。
PS.STAMP这个名字取得好啊,邮戳,给靶标RNA打上“标记”!!!
Reference
Brannan, K. W. et al. Robust single-cell discovery of RNA targets of RNA-binding proteins and ribosomes. Nat Methods 18, 507-519 (2021).
网友评论