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根据坐标截取拟南芥序列

根据坐标截取拟南芥序列

作者: 大海龟啦啦啦 | 来源:发表于2021-10-23 09:11 被阅读0次
还在为不会截取拟南芥序列烦恼吗？BRAD V3.0给你一个解决办法！

步骤十分的简单。

  1. 进入到BRAD V3.0的基因组序列截取页面，选择拟南芥基因组为参考基因组并输入相应的染色体、起始终止位点和正反义链信息。
    (http://brassicadb.cn/#/GenomicSequenceRetrieval/)
    如下图所示

    输入相应信息之后点击Search按钮进行检索。

  2. 得出结果如下图所示



    “1”为截取的基因组序列，可以直接拷贝进行使用，同时还提供了“2”这个按钮可供下载为fasta格式的数据以供后续的分析。

BRAD V3.0 (http://brassicadb.cn)是芸薹属数据库BRAD的全新版本，已经成为重要的十字花科物种门户网站，其中已经包含了26个物种的36个参考基因组，还开发了不少小工具，可以满足不会编程的小伙伴们的一些简单需求。欢迎大家进行访问和引用。

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