1. 组装基因组质控 得到组装好的基因组序列之后,首先要使用多种方法评估组装质量。这里用到2款可用于基因组组装质量...
零、相关概念 一、数据质控控制 二、 kmer基因组评估 三、基因组拼接 第四步、评估组装结果 五、基因注释
BioNano以cmap格式存放光学图谱,为了评估基因组的组装质量或者了解光学图谱中冗余情况(高杂合基因组组装结果...
基因组和转录组组装质量评估利器——BUSCO(Benchmarking Universal Single-Copy...
基因组组装完成后,可通过N50或者BUSCO,以及LAI评估组装质量。本文就LAI方法做一简单介绍。 基因组中的重...
(1) 序列一致性评估 较高的mapping rate(90%以上)以及coverage(95%以上)认为组装结果...
转载自 LAI: 评估基因组质量一个标准 基因组组装完成之后,就需要对最后的质量进行评估。我们希望得到的cont...
简介 BUSCO是一款对转录组和基因组组装质量进行评估的软件,它可以利用相近的物种的保守序列与组装的结果进行比对,...
细菌基因组组装金标准:GAGE-B 组装软件的选择 细菌基因组组装的目标不同于大型生物基因组的组装,大型基因组组装...
本文标题:基因组组装与评估
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