继续分享m6A的reader相关研究。今天介绍的是一类新的m6A reader蛋白——SND1。不过这项研究最初的目的可能并不是为了鉴定SND1是否是m6A的reader,研究者可能是想研究卡波西肉瘤疱疹病毒(KSHV)RNA上的m6A修饰,发现SND1可以作为m6A reader结合这些病毒基因组转录的RNA,并促进这些RNA的稳定性,进而影响病毒在细胞中的复制。
SND1结合m6A修饰
三言两语
- 利用m6A-seq数据,分析发现KSHV转录的RNA上存在m6A修饰,主要分布在这些RNA的CDS和3UTR上。
2.基于KSHV 带m6A修饰的RNA序列,合成相应的探针,进行体外的RNA pulldown实验,联合蛋白质谱分析,发现除了经典的YTH家族 reader蛋白外,m6A修饰探针能显著富集SND1蛋白。进一步的体外重组蛋白与m6A探针结合实验也证实,SND1是m6A的reader。
3.SND1通过识别KSHV RNA上的m6A修饰,促进其稳定性,进而促进KSHV在宿主细胞中的复制。
Reference
Baquero-Perez, B. et al. The Tudor SND1 protein is an m(6)A RNA reader essential for replication of Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus. Elife 8 (2019).
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