007-16S序列分析,OTU表格及分类

作者: quan575 | 来源:发表于2017-07-13 15:44 被阅读73次

    网站

    http://www.qplot.cn:3838/apps/007-16S_OTUtax/

    这是一个整合多个分析的APP,导入OTU 丰度表格以及注释信息,
    可以进行各级别统计、聚类、PCA、柱形图。

    输入文件格式如下,(制表符分隔的纯文本文件)


    OTU表格文件 行为OTU 列为样本.png tax分类信息文件 行为OTU 列为分类级别.png

    如果想比较组间差异,可输入分组文件(可选),格式如下


    分组文件.png

    下面是部分分析图

    聚类树 venn图 聚类树与柱形图.png pca分析

    相关文章

      网友评论

      • 17b9c899a669:很赞,试用了一下,有个问题,tax分类信息文件按照你的图片上传,报错了,不明白为什么
        17b9c899a669:@圈圈575 期待示例文件,谢谢
        quan575: @孙伟清tax文件的列名需要全小写,应为做的时候需要匹配列名,下次我上传个示例文件吧
      • KingR:这么久在憋大招啊:smile:
        KingR:@圈圈575 坚持啊,有二十个观众呢,现在简书首页都是辣鸡文章,你是一股清流啊。你有自己的主页或者博客么,这里看鸡汤的人多,看这个的人少。
        quan575:好久没更新了,主要是自己太懒了:smiley:

      本文标题:007-16S序列分析,OTU表格及分类

      本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/bbgwhxtx.html