随着序列数的增加,物种数是否增长。以检测测序深度是否足够 地址:http://qplot.cn/apps/017-rarefaction/ 介绍以后补上。
如图:
随着序列数的增加,物种数是否增长。以检测测序深度是否足够地址:http://qplot.cn/apps/017-r...
首先利用qiime diversity alpha-rarefaction命令进行Alpha多样性指数稀释曲线分析...
具体选择哪种subsample方法,结果都差不多。 USEATCH的稀释曲线和QIIME稀释曲线不同, QIIME...
稀释曲线 稀释曲线(Rarefaction Curve,也称稀疏曲线):一般在微生物组研究中用于评估测序量或样本量...
在微生物测序分析及相关的文章中,我们经常可以看到这样的图,称为稀释曲线(Rarefaction curves)。 ...
简介 通过Rank Abundance曲线、稀释曲线、物种累积箱形图(species accumulation b...
本节我们将介绍Alpha多样性如何分析,具体包括三部分的内容:Alpha稀释曲线、计算比较Alpha多样性的差异、...
1.构建系统发育树 2.稀释曲线 3.多样性分析1)根据ASV的最小测序深度设置sampling参数 2)alph...
017-王兴旺
建立标准曲线: 梯度稀释的标准品;空白管,即不加样品;测量值 以梯度稀释浓度为横坐标,以测量值为纵坐标,进行拟合得...
本文标题:017-稀释性曲线
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/evsoqqtx.html
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