在线工具一般具有“功能强大、操作简单、无需安装、用完就走”的特点，轻松实现“用别人的服务器分析自己的数据”。
基因结构绘制
1.Exon-Intron Graphic Maker
工具链接：
ttp://www.wormweb.org/exonintron
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RNA二级结构
2.Mfold
工具链接：
http://unafold.rna.albany.edu/?q=mfold
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3.RNAfold
工具链接：
http://rna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAWebSuite/RNAfold.cgi
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蛋白互作网络
4.String
工具链接：
https://string-db.org/
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基因共表达网络
5.Coexpedia:
工具链接：
http：//www.coexpedia.org/
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序列Motif
6.MEME
工具链接：
http://meme-suite.org/
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7.Weblogo
工具链接：
http://weblogo.threeplusone.com/
image.png
基因信息查找
8.Genecard
工具链接：
http://www.genecards.or
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序列展示
9.ESPript:
工具链接：
http://espript.ibcp.fr/ESPript/cgi-bin/ESPript.cgi
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Gene ID转化
10.BioMart
工具链接：
http://www.ensembl.org/index.html
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11.g:profiler
工具链接：
https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/convert
image
12.UniPort Retrieve/ID mapping
工具链接：
https://www.uniprot.org/uploadlists/
image.png
13.bioDBnet
工具链接：
https://biodbnet-abcc.ncifcrf.gov/
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韦恩图
14.Venny2.0
工具链接：
http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html
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15.OmicShare 韦恩图工具
工具链接：
http://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/venn
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三元图
16.Ternary plot maker
工具链接：
https://www.ternaryplot.com/
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基因结构分析
17.FGENES
工具链接：
http://softberry.com/
image.png
范例结果：
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系统发育分析
18.iTOL
工具链接：
https://itol.embl.de/
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19.Evolview
工具链接：
http://www.evolgenius.info/evolview/
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启动子预测
20.Promoter Scan
工具链接：
http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/
image.png
蛋白一级结构预测
21.PredictProte
工具链接：
https://www.predictprotein.org/home
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22.ProtParam tool
工具链接：
http://web.expasy.org/protparam/
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信号肽预测
23.SignalP
工具链接：
http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
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跨膜结构域
24.TMHMM Server v. 2.0
工具链接：
http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/
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亚细胞定位
25.PSORT
工具链接：
https://www.psort.org/
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蛋白三级结构预测
26.SWISS-MODEL
工具链接：
https://swissmodel.expasy.org/
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27.Phyre2
工具链接：
http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/html/page.cgi?id=index
image
短序列拼接
28.Cap3
工具链接：
http://doua.prabi.fr/software/cap3
image.png
GO富集分析
29.OmicShare GO富集分析工具
工具链接：
http://www.omicshare.com/tools/home/report/goenrich.html
image
KEGG富集分析
30.OmicShare KEGG富集分析工具
工具链接：
http://www.omicshare.com/tools/home/report/koenrich.html
image
趋势分析
31.OmicShare 趋势分析工具
工具链接：
http://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/trend
image
蛋白结构域预测
32.Pfam
工具链接：
http://pfam.xfam.org/search
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33.SMART
工具链接：
http://smart.embl-heidelberg.de/
image
基因组杂合性评估
34.GenomeScope
工具链接：
http://qb.cshl.edu/genomescope/analysis.php?code=example2
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圈图
35.CIRCOS
工具链接：
http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/
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36.热图
Omicshare 热图工具
工具链接：
http://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/heatmap
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注释工具
37.Omicshare 注释工具
工具链接：
https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/getsoft/type/annotation
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细胞标记
38.CellMarker
工具链接：
http://biocc.hrbmu.edu.cn/CellMarker/index.jsp
circRNA数据库
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circRNA
39. circBase
工具链接：
http://www.circbase.org/
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40. CIRCpedia
工具链接：
http://www.picb.ac.cn/rnomics/circpedia/
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small RNA
41. deepBase
工具链接：
http://rna.sysu.edu.cn/deepBase/
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42. sRNAanno
工具链接：
www.plantsRNAs.org
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lncRNA
43. TANRIC
工具链接：
http://bioinformatics.mdanderson.org/main/TANRIC:Overview
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44. NONCODE
工具链接：
http://www.noncode.org/
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ceRNA
45. starBase
工具链接：
http://rna.sysu.edu.cn/deepBase/
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46. miRSponge
工具链接：
http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/miRSponge/
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序列翻译
47. ExPASy Translate tool
工具链接：
https://web.expasy.org/translate/
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48. ORFfinder
工具链接：
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/
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本文转载于微信公众号“生物信息学习”，仅用于学术分享！
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