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2021-07-05 RNA m6A修饰位点鉴定新策略-3

2021-07-05 RNA m6A修饰位点鉴定新策略-3

作者: NAome | 来源:发表于2021-07-05 23:05 被阅读0次

      DART-seq 则是利用m6A的特异性识别功能域(YTH domain)将胞嘧啶脱氨酶APOBEC1招募至m6A修饰位点附近,依靠APOBEC1的C-U的嘧啶转化,结合RNA-seq技术,通过鉴定C到U的突变也可以实现不依赖于抗体的m6A修饰位点鉴定。


    DART-seq

    PS.根据这种思路,可以将拟研究的RBP与APOBEC1进行融合,然后基于编辑位点判断RBP潜在的靶标。

    Reference
    Meyer KD. DART-seq: an antibody-free method for global mA detection. Nature methods, 2019, 16: 1275-1280

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