[NAR|2019] WebSestalt 基因列表的富集分析

我们经常在进行差异表达分析之后，对于差异表达的基因，下一步是要对这些基因进行聚类分析的，通过聚类分析来对这些基因进行分组。WebSestalt是对差异表达的结果进行聚类分析的数据库。这个数据库提供了三种聚类分析的方式，富集分析； GSEA分析； 网络分析

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由于三者分析的输入都相似，所以我们使用GSEA分析来演示

输入

数据库的输入主要是来输入差异表达分析后的结果，其他的都是选择适合自己的选项即可。

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1. 物种选择：数据库支持13种物种的分析

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2. 选择分析方式：网站支持三种分析方式(富集分析，GSEA分析，网络相互作用分析)

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3. 选择具体的分析分类

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4. 输入数据。这里的输入可以指定不同的Gene ID。需要注意的是，数据库在GSEA分析当中还需要输入 fold change的值。别的则不用

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输出

结果会以图片和表格的形式来进行展示，

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代码行

数据库还提供了R包可以让我们使用。具体的R包为 WebGestaltR需要的童鞋去看一下官方文档。